Черт его знает, может это из-за того, что кряк кривой, а патч не все его огрехи исправляет. Но большой проблемы в этом случае я не вижу. Можно ведь сохранить в DOC, а из него уже в TXT.
По поводу DjvuOCR 2.3. Насколько я помню,
он сам делает правильно форматированную заготовку с OCR из всего пакета Файн Ридера и вставляет ее в DJVU. Там ведь не голый текст нужен, но еще и координаты слов или строчек. Поэтому пытаться приклеить Файн-ридерский TXT к DJVU - это совершенно бессмысленное занятие. Надо в DjvuOCR указать пакет(папку) FR и DJVU-файл (со включенной галочкой Burn), а больше ничего не требуется.  Ну и еще, кажется, надо придумать название для временного TXT, который на самом деле не TXT, а совсем другой формат.

Если Вам OCR нужен только для встройки в DJVU, то НЕ НАДО сохранять результат распознавания в TXT напрямую или с промежуточным DOC или PDF!
Просто распознайте и все. Потом запустите DjvuOCR, он САМ извлечет текстовую информацию с координатами из пакета FR и прилепит ее к DJVU. Только следите, чтобы порядок страниц в пакете и в DJVU был одинаковым.

Насчет того "будут ли квадратики" я не уверен - у Вас явно неудачно сломанный ФР. Лучше бы заменить его, чтобы не возникало проблем.

Не может быть такого, чтобы 300 кб не пролезало. Таких ограничений давно уже нигде нет. Возможно, просто сервер глючит или доступное место кончилось. Вроде бы на Народе объем сайта можно увеличить где-то в настройках.
О сжатии RAR-ом. DJVU обычно только чуть-чуть сжимается. Хотя в теме http://publ.lib.ru/cgi/forum/YaBB.pl?num=1110891069/30#30 (сообщ. 51-52) был пример довольно сильного сжатия.
А уменьшить djvu можно путем правильной обработки сканов и выбором параметров кодирования:
1) очистка от пятен грязи (мелкие - деспеклом, крупные - вручную)
2) постраничная разрезка разворотов и выравнивание страниц
3) сглаживание букв и line-art
4) выбор агрессивного сжатия
5) задание большого размера словаря (для многостраничных файлов)
6) можно еще дополнительно обработать сканы с помощью CPC Tool
Т.е., вкратце, надо убрать ненужную инфу (грязь) и сделать как можно больше сходных букв перед кодированием.

Сейчас многие делают хорошие сканы по методике Scan&Share. Может и Вам попробовать?

Ретро РЗиА писал(а) 19.05.2008 :: 11:26:39:

Это обсуждалось на форумах еще на заре "дежавюизации всей страны". Насколько помню, пришли к соглашению, что нормально, когда страничка в djvu весит 7-15 кб (300 dpi, ч-б, ~A5 формата, полностью заполненная текстом, без картинок). Для 600 dpi нормально, наверное, 10-20 кб.

Ретро РЗиА писал(а) 19.05.2008 :: 11:26:39:

Методика не Мандея, а by 4u4undr/VladimirTT. Она только для необработанных серых сканов предназначалась (с переводом в 600 dpi ч-б сканы).  А если Вы взяли ч-б сканы и увеличили по методике до 600 dpi Кромсатором, то размер и должен сильно вырасти. Информации (пикселов) стало ведь в 4 раза больше (но наличие сходных букв уменьшило размер).
Если Вы дополнительно не улучшаете исходный скан сглаживанием букв, то никакого смысла увеличивать dpi в Вашем случае нет. Получится то же самое, что и в случае 300 dpi, только размер файла увеличится.
А вообще, размер сейчас уходит на второй план (у многих анлим или дешевый трафик), поэтому лучше заботиться прежде всего о качестве. 

Ретро РЗиА писал(а) 19.05.2008 :: 11:26:39:

Попробуйте обратиться в техподдержку Народа.
Спасибо за сайт. Очень полезное и нужное дело делаете.